Во втором сезоне все начинается с находки, которую обнаружил Кларк Кент - это огромная пещера со странными рисунками на ней. Кент понимает, что он не простой парень, а у него есть на Земле определенная миссия. Благодаря рисункам он узнает настоящее имя его родной планеты - Криптон, и о фрагментах после метеоритного дождя, которые дают людям сверхспособности. Эти кристаллы являются остатками его родной планеты, которая после взрыва мелкими кусочками упала на Землю. Ученый помогает Кларку собрать информацию о Криптоне. Он узнает, что каждый кристалл имеет различную мощность, которая зависит от цвета минерала. Кларк изучал надписи на камнях и правильно понимает, что его цель на земле, чтобы поработить человечество. Но сделает ли он правильное решение, если его приемные родители привили ему любовь с самого детства?